Palle Nielsen var en særdeles produktiv og meget systematisk grafiker. Han arbejdede i serier, ofte over lange perioder og gerne med flere forskellige serier på en gang. Serierne fik desuden lov at udvikle sig frit inden for forskellige teknikker, og teknikken i sig selv afgrænser derfor ikke en serie. Herunder ses en oversigt over de vigtigste serier på tværs af grafiske teknikker:
- (Croquis)
- Ambrosius Stub (Illustration)
- Angstens serie
- Antikrigsbilleder
- Bebudelsesmotiv
- Bevægelse
- Bipersonerne (Illustration)
- Den barmhjertige samaritan
- Den forladte by
- Den fortryllede by
- Den fortryllede by I
- Den fortryllede by II
- Den sovende by
- Den store verdensbunker
- Drømmebyen
- Forureningsblad - til fordel for NOAH
- Fuga
- Gadebilleder
- Gethsemane
- Hamburg Hansaplatz
- Historien om bunken (Illustration)
- Ignalina
- Insekt
- Isola (Orfeus og Eurydike II)
- Klagesange
- Kvadratserie
- Lethe
- Lille raderserie
- Lille raderserie II
- Lille træsnitserie
- Mennesker og begivenheder
- Miraklernes tid
- Mord i gaslys (Ilustration)
- Mysterier
- Månebyen
- Måneserie
- Nattebyen
- Nekropolis
- Notat
- Ofrene (Vietnam)
- Opstandelse
- Orfeus og Eurydike I
- Orfeus og Eurydike III
- Pandæmonium
- Parklandet
- Passion
- Rekviem
- San Cataldo-serie
- Serie uden navn
- Serien uden navn. 12 penseltegninger skåret i linoleum
- Soldaten og barnet
- Stederne
- Syndflod
- Sørgeblad for 18. maj
- Til dem der kommer efter os
- Timebog
- Udbryderkonge
- Vejen til byen
- Vejen til byen I
- Vejen til byen II